HIV
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| Virus de l'immunod??ficience humaine | |
|---|---|
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| micrographie ??lectronique ?? balayage du VIH-1 (en vert) en herbe de lymphocytes cultiv??s. Plusieurs bosses rondes sur la surface des cellules repr??sentent des sites d'assemblage et le bourgeonnement des virions. | |
| Classification des virus | |
| Groupe: | Groupe VI ( ssRNA-RT) |
| Famille: | Retroviridae |
| Genre: | Lentivirus |
| Esp??ce | |
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Virus de l'immunod??ficience humaine (VIH) est un lentivirus (reproduisant lentement r??trovirus) qui provoque le syndrome d'immunod??ficience acquise (SIDA), une condition chez l'homme dans lequel d??faillance progressive du syst??me immunitaire permet la vie en danger infections opportunistes et les cancers de se d??velopper. L'infection ?? VIH a lieu par le transfert de sang , sperme, les s??cr??tions vaginales, pr??-??jaculatoire, ou le lait maternel. Dans ces fluides corporels, le VIH est pr??sent que deux particules virales libres et virus dans infect??s cellules du syst??me immunitaire.
Le VIH infecte les cellules vitales dans le syst??me immunitaire humain, tels que les cellules T auxiliaires (en particulier Cellules T CD4 +), macrophages, et cellules dendritiques. Infection par le VIH conduit ?? de faibles niveaux de Cellules T CD4 + par un certain nombre de m??canismes, y compris: apoptose des cellules de voisinage non infect??es, assassinat virale directe de cellules infect??es, et la destruction des cellules T CD4 + infect??s par le CD8 des lymphocytes cytotoxiques qui reconnaissent les cellules infect??es. Lorsque le nombre de cellules T CD4 + tombent au-dessous d'un niveau critique, immunit?? ?? m??diation cellulaire est perdue, et le corps devient de plus en plus sensibles aux infections opportunistes.
Virologie
Classification
| Esp??ce | Virulence | Infectiosit?? | Pr??valence | Origine pr??sum??es |
|---|---|---|---|---|
| VIH-1 | ??lev?? | ??lev?? | Mondial | Chimpanz?? commun |
| HIV-2 | Inf??rieur | Faible | Afrique De L'Ouest | Sooty Mangabey |
Le VIH est un membre du genre Lentivirus, qui fait partie de la famille des Retroviridae. Les lentivirus ont beaucoup morphologies et biologiques propri??t??s en commun. De nombreuses esp??ces sont infect??s par les lentivirus, qui sont responsables de maladies caract??ristique de longue dur??e avec une longue p??riode d'incubation. Les lentivirus sont transmises sous forme simple brin, en positif sens, envelopp?? les virus ?? ARN. Lors de l'entr??e dans la cellule cible, le viral ARN g??nome est converti (transcription inverse) en double-brin de l'ADN par un cod??e par le virus transcriptase inverse qui est transport?? en m??me temps que le g??nome viral dans la particule virale. L'ADN viral obtenu est ensuite import??es dans le noyau de la cellule et int??gr?? dans l'ADN cellulaire par une cod??es viralement int??grase et d'accueil des co-facteurs. Une fois int??gr??, le virus peut devenir latente, permettant au virus et sa cellule h??te pour ??viter la d??tection par le syst??me immunitaire. Autrement, le virus peut ??tre transcrite, la production de nouveaux g??nomes ?? ARN et des prot??ines virales qui sont emball??s et lib??r?? de la cellule que de nouvelles particules virales qui commencent le cycle de r??plication de nouveau.
Deux types de VIH ont ??t?? caract??ris??s: VIH-1 et VIH-2. VIH-1 est le virus qui a ??t?? initialement d??couvert et appel?? LAV fois et HTLV-III. Il est plus plus virulent, infectieux, et est la cause de la majorit?? des infections ?? VIH ?? l'??chelle mondiale. L'infectiosit?? plus faible du VIH-2 par rapport au VIH-1 implique que moins de ceux qui sont expos??s au VIH-2 seront infect??s par l'exposition. En raison de sa relativement faible capacit?? de transmission, le VIH-2 est largement confin??e ?? l'Afrique de l'Ouest .
Structure et g??nome
Le VIH est diff??rent des autres dans la structure des retrovirus. Il est plus ou moins sph??rique avec un diam??tre d'environ 120 nm, environ 60 fois plus petit qu'un des globules rouges, mais pour un grand virus. Il est compos?? de deux copies de simple brin positif ARN qui code pour le virus de neuf g??nes d??limit??es par une forme conique capside compos??e de 2000 copies de la prot??ine virale p24. L'ARN simple brin est ??troitement li??e ?? la nucl??ocapside, les prot??ines, p7 et enzymes n??cessaires ?? l'??laboration du virion comme transcriptase inverse, les prot??ases, ribonucl??ase et int??grase. Une matrice compos??e de la prot??ine virale p17 de la capside entoure assurer l'int??grit?? de la particule de virion.
Ce est, ?? son tour, entour?? par la enveloppe virale qui est compos?? de deux couches de mol??cules appel??es gras prises phospholipides de la membrane d'une cellule humaine lorsqu'un bourgeons de particules de virus nouvellement form??s ?? partir de la cellule. Incorpor?? dans l'enveloppe virale sont des prot??ines de la cellule h??te et environ 70 copies d'une prot??ine du VIH complexe qui fait saillie ?? travers la surface de la particule de virus. Cette prot??ine, appel??e Env, se compose d'un capuchon en trois mol??cules appel??es glycoprot??ine (GP) 120, et une tige compos??e de trois gp41 mol??cules qui ancrent la structure dans l'enveloppe virale. Ce complexe glycoprot??ine permet au virus de se fixer et fusionner avec des cellules cibles pour initier le cycle infectieux. Ces deux prot??ines de surface, en particulier la gp120, ont ??t?? consid??r??es comme des cibles de traitements ou futurs vaccins contre le VIH.
Le g??nome d'ARN est constitu??e d'au moins sept points de rep??re structurels ( LTR, TAR, RRE, PE, SLIP, CRS, et INS), et neuf g??nes (gag, pol et env, tat, rev, nef, vif, vpr, vpu, et parfois dixi??me TeV, qui est une fusion de tat env et rev ), codant pour 19 prot??ines. Trois de ces g??nes, gag, pol et env, contiennent des informations n??cessaires pour prendre les prot??ines structurales de nouvelles particules virales. Par exemple, les codes env pour une prot??ine appel??e gp160 qui est d??compos?? par une prot??ase cellulaire pour former gp120 et gp41. Les six g??nes restants, tat, rev, nef, vif, vpr, vpu et (ou vpx dans le cas du VIH-2), sont des g??nes de r??gulation pour des prot??ines qui contr??lent la capacit?? du VIH ?? infecter les cellules, produire de nouvelles copies du virus ( r??pliquer), ni provoquer de maladie.
Les deux prot??ines Tat (p16 et p14) sont transactivateurs transcription pour le promoteur LTR agissant en liant l'??l??ment TAR ARN. Le TAR peut aussi ??tre transform?? en microARN qui r??gulent le g??nes d'apoptose ERCC1 et IER3. Le prot??ine Rev (p19) est impliqu?? dans la navette ARN du noyau et le cytoplasme en se liant ?? la ARN ??l??ment RRE. La prot??ine Vif (p23) emp??che l'action de APOBEC3G (une prot??ine cellulaire qui d??samine hybrides ADN: ARN et / ou interf??re avec la prot??ine Pol). Le prot??ine Vpr (p14) arrestations la division cellulaire au G2 / M. La prot??ine Nef (p27) r??gule ?? la baisse CD4 (le principal de r??cepteur viral), ainsi que la CMH de classe I et des mol??cules de classe II.
Nef interagit ??galement avec Domaines SH3. La prot??ine Vpu (p16) influe sur la lib??ration de nouvelles particules virales de cellules infect??es. Les extr??mit??s de chaque brin d'ARN du VIH contiennent une s??quence d'ARN appel??e longue r??p??tition terminale (LTR). Les r??gions LTR agissent comme des interrupteurs pour contr??ler la production de nouveaux virus et peut ??tre d??clench??e par des prot??ines du VIH ou de la cellule h??te. Le ??l??ment de Psi est impliqu?? dans l'emballage du g??nome viral et reconnu par prot??ines Gag et Rev. L'??l??ment de glissement (TTTTTT) est impliqu?? dans le cadre de lecture dans le cadre de lecture Gag-Pol Pol n??cessaire pour rendre fonctionnelle.
Tropisme
Le terme fait r??f??rence ?? tropisme viral qui infecte les types cellulaires du VIH. Le VIH peut infecter une grande vari??t?? de cellules immunitaires telles que Cellules T CD4 +, macrophages, et les cellules microgliales. VIH-1 ?? l'entr??e des macrophages et des cellules T CD4 + est m??di??e par l'interaction de glycoprot??ines d'enveloppe du virion (gp120) avec la mol??cule CD4 sur les cellules cibles et ??galement avec cor??cepteurs de chimiokines.
Macrophage (M-tropique) souches de VIH-1, ou non souches de syncitia induisant (INS) utilisent le r??cepteur β -chemokine CCR5 pour l'entr??e et sont, par cons??quent, capable de se r??pliquer dans les macrophages et les cellules T CD4 +. Ce cor??cepteur CCR5 est utilis?? par presque toutes les ??coles primaires de VIH-1 ind??pendamment du sous-type g??n??tique viral. En effet, les macrophages jouent un r??le cl?? dans plusieurs aspects essentiels de l'infection ?? VIH. Ils semblent ??tre les premi??res cellules infect??es par le VIH et peut-??tre ?? l'origine de la production de VIH quand les cellules CD4 + sont ??puis??es dans le patient. Les macrophages et les cellules microgliales sont les cellules infect??es par le VIH dans le syst??me nerveux central. Dans les amygdales et la ad??no??des de patients infect??s par le VIH, les macrophages fusionnent en cellules g??antes multinucl????es qui produisent d'??normes quantit??s de virus.
T-tropique isole, ou syncitia induisant (SI) souches r??pliquer dans les cellules T CD4 + primaires ainsi que dans les macrophages et utiliser le r??cepteur α -chemokine, CXCR4, pour l'entr??e. Tropisme double souches VIH-1 sont consid??r??es comme transitoires souches de VIH-1 et sont donc en mesure d'utiliser les deux CCR5 et CXCR4 co-r??cepteurs pour l'entr??e virale.
L'α -chemokine SDF-1, un ligand pour CXCR4, supprime la replication du T-tropiques isolats VIH-1. Elle le fait en sous-r??guler l'expression de CXCR4 sur la surface de ces cellules. VIH qui ne utilisent que le r??cepteur CCR5 sont appel??s R5; ceux qui utilisent seulement CXCR4 sont appel??s X4, et ceux qui utilisent ?? la fois, X4R5. Cependant, l'utilisation de cor??cepteur seule ne explique pas tropisme viral, comme tous les virus R5 ne sont pas en mesure d'utiliser CCR5 sur les macrophages pour une infection productive et le VIH peut ??galement infecter un sous-type de cellules dendritiques my??lo??des, qui constituent probablement un r??servoir qui maintient l'infection lorsque le nombre de cellules T CD4 + ont diminu?? ?? des niveaux extr??mement bas.
Certaines personnes sont r??sistants ?? certaines souches de VIH. Par exemple, les personnes atteintes de la CCR5-Δ32 mutation sont r??sistantes ?? l'infection par le virus R5, comme la mutation emp??che le VIH de se lier ?? cette co-r??cepteur, r??duisant ainsi sa capacit?? ?? infecter des cellules cibles.
Les rapports sexuels sont le principal mode de transmission du VIH. Les deux X4 et R5 du VIH sont pr??sents dans le liquide s??minal, qui est pass?? d'un m??le ?? son partenaire sexuel. Les virions peuvent ensuite infecter de nombreuses cibles cellulaires et de diffuser dans tout l'organisme. Toutefois, un processus de s??lection aboutit ?? la transmission du virus pr??dominant R5 par cette voie. Comment ce processus fonctionne s??lective est toujours sous enqu??te, mais un seul mod??le, ce est que spermatozo??des peut effectuer s??lectivement R5 VIH car ils poss??dent ?? la fois CCR3 et CCR5 mais pas CXCR4 sur leur surface et que g??nitales cellules ??pith??liales s??questrent pr??f??rentiellement virus X4. Chez les patients infect??s par le sous-type B du VIH-1, il ya souvent un commutateur co-r??cepteur dans la maladie ?? un stade avanc?? et des variantes T-tropique semblerait que peuvent infecter une vari??t?? de cellules T par CXCR4. Ces variantes puis r??pliqu??es plus agressive avec virulence accrue qui provoque l'??puisement rapide des lymphocytes T, effondrement du syst??me immunitaire, et les infections opportunistes qui marquent l'av??nement du SIDA. Ainsi, au cours de l'infection, l'adaptation du virus ?? l'utilisation de CXCR4 au lieu de CCR5 peut ??tre une ??tape cl?? dans la progression vers le SIDA. Un certain nombre d'??tudes sous-type B individus infect??s ont d??termin?? que entre 40 et 50 pour cent des patients atteints du SIDA peut h??berger des virus de l'IS et, il est pr??sum??, les ph??notypes X4.
VIH-2 est beaucoup moins pathog??ne que le VIH-1 et est limit?? dans sa distribution dans le monde entier. L'adoption de "g??nes" accessoires par le VIH-2 et son mod??le plus la promiscuit?? de l'utilisation de cor??cepteur (y compris les CD4-ind??pendance) peut aider le virus dans son adaptation ?? ??viter les facteurs de restriction inn??es pr??sentes dans les cellules h??tes. Adaptation ?? utiliser la machinerie cellulaire pour permettre la transmission normale et l'infection productive a aussi aid?? l'??tablissement de la replication du VIH-2 chez l'homme. Une strat??gie de survie pour tout agent infectieux ne est pas de tuer son h??te mais finalement devenir un organisme commensal. Ayant atteint un faible pathog??nicit??, au fil du temps, des variantes plus de succ??s ?? l'??mission seront s??lectionn??s.
cycle de r??plication
Entr??e ?? la cellule
Entre le VIH les macrophages et les cellules CD4 + Lymphocytes T par le adsorption de glycoprot??ines sur sa surface ?? des r??cepteurs sur la cellule cible suivie par la fusion de la l'enveloppe virale avec la membrane cellulaire et la lib??ration de la capside du VIH dans la cellule.
L'acc??s ?? la cellule commence par l'interaction du complexe trim??rique enveloppe ( pic gp160) et les deux CD4 et un r??cepteur de chimiokine (g??n??ralement soit CCR5 ou CXCR4, mais d'autres sont connus pour interagir) sur la surface cellulaire. se lie ?? gp120 int??grine α 4 β 7 activation LFA-1 int??grine centrale impliqu??s dans la mise en place des synapses virologiques, qui facilitent efficace de cellule ?? cellule propagation du VIH-1. Le pic de gp160 contient des domaines de liaison ?? la fois CD4 et les r??cepteurs de chimiokines.
La premi??re ??tape de fusion comprend la fixation ?? haute affinit?? de la liaison de domaines de CD4 gp120 au CD4. Une fois que la gp120 est li?? avec la prot??ine CD4, le complexe de l'enveloppe subit un changement structurel, exposant les domaines de la gp120 de liaison des chimiokines et leur permettant d'interagir avec le r??cepteur de chimiokine cible. Ceci permet une fixation ?? deux volets plus stable, ce qui permet le peptide de fusion gp41 N-terminale de p??n??trer dans la membrane cellulaire. R??p??tez les s??quences de la gp41, HR1 et HR2 interagissent alors, provoquant l'effondrement de la partie extracellulaire de la gp41 dans une ??pingle ?? cheveux. Cette structure de boucle am??ne les virus et les membranes cellulaires rapproch??s, ce qui permet la fusion des membranes et de l'entr??e ult??rieure de la capside virale.
Apr??s le VIH est li??e ?? la cellule cible, le VIH ARN et divers enzymes, y compris la transcriptase inverse, l'int??grase, la ribonucl??ase, et la prot??ase, sont inject??s dans la cellule. Pendant le transport sur la base microtubules vers le noyau, le g??nome viral simple brin de l'ARN est transcrit en ADN double brin, qui est ensuite int??gr?? dans un chromosome de l'h??te.
VIH peut infecter cellules dendritiques (CD) de ce CD4- CCR5 itin??raire, mais un autre itin??raire ?? l'aide de type C des r??cepteurs de lectine sp??cifique du mannose tels que DC-SIGN peut ??galement ??tre utilis??. PED sont l'une des premi??res cellules rencontr??es par le virus au cours de la transmission sexuelle. Ils sont actuellement semble jouer un r??le important en transmettant le VIH aux lymphocytes T lorsque le virus est captur?? dans le muqueuse par les CD. La pr??sence de FES-1, qui se produit naturellement dans neurones, on pense ?? pr??venir l'infection des cellules par le VIH.
R??plication et la transcription
Peu de temps apr??s la capside virale p??n??tre dans la cellule, un enzyme appel??e transcriptase inverse lib??re le simple brin (+) G??nome ARN des prot??ines virales attach??s et le copie dans un ADN compl??mentaire (ADNc) mol??cule. Le processus de transcription inverse est extr??mement sujette ?? erreur, et les mutations r??sultant peut causer la r??sistance aux m??dicaments ou permettent au virus d'??chapper au syst??me immunitaire du corps. La transcriptase inverse a ??galement une activit?? de ribonucl??ase qui d??grade l'ARN viral au cours de la synth??se d'ADNc, ainsi que l'activit?? de polym??rase d'ADN d??pendant de l'ADN qui cr??e un ADN sens ?? partir de l'ADNc anti-sens. Ensemble, l'ADNc et son compl??ment forment un ADN double brin viral qui est ensuite transport?? dans la noyau de la cellule. L'int??gration de l'ADN viral dans la cellule h??te de g??nome est effectu??e par une autre enzyme virale int??grase.
Cet ADN viral int??gr?? peut alors rester en sommeil, dans la phase latente de l'infection ?? VIH. Pour produire activement le virus, certains cellulaire les facteurs de transcription doivent ??tre pr??sentes, dont le plus important est NF-κ B (NF kappa B), qui est r??gul??e ?? la hausse lorsque les lymphocytes T sont activ??s. Cela signifie que les cellules les plus susceptibles d'??tre tu??s par le VIH sont ceux qui combattent les infections moment.
Au cours de la r??plication virale, l'ADN int??gr?? provirus est transcrit en ARNm, qui est ensuite ??piss?? en petits morceaux. Ces petits morceaux sont export??s ?? partir du noyau dans le cytoplasme, o?? ils sont traduites en prot??ines r??gulatrices Tat (qui encourage la production de nouveaux virus) et Rev. Comme la prot??ine Rev nouvellement produite se accumule dans le noyau, il se lie ?? l'ARNm viraux ARN non ??piss??s et permet de quitter le noyau, o?? ils sont retenus jusqu'?? ce que ??piss?? autrement. A ce stade, les prot??ines structurales gag et env sont produites ?? partir de l'ARNm de pleine longueur. L'ARN de pleine longueur est en fait le g??nome du virus; il se lie ?? la prot??ine Gag et est conditionn?? dans de nouvelles particules virales.
VIH-1 et VIH-2 semblent conditionner leur ARN diff??remment; VIH-1 se lie ?? l'ARN appropri?? quelconque, alors que le VIH-2 sera pr??f??rentiellement se lier ?? l'ARNm qui a ??t?? utilis?? pour cr??er la prot??ine Gag lui-m??me. Cela peut signifier que le VIH-1 est mieux capable de muter (VIH-1 infection progresse au SIDA plus rapidement que le VIH-2 et est responsable de la majorit?? des infections mondiales).
Assembl??e et la lib??ration
La derni??re ??tape du cycle viral, l'assemblage des nouveaux virions VIH-1, commence ?? la membrane plasmique de la cellule h??te. La polyprot??ine Env (gp160) passe par le r??ticulum endoplasmique et est transport?? vers la complexe de Golgi o?? il est cliv?? par furine r??sultant dans les deux glycoprot??ines d'enveloppe du VIH, gp41 et gp120. Ceux-ci sont transport??s vers la la membrane plasmique de la cellule h??te o?? gp41 gp120 ancre ?? la membrane de la cellule infect??e. Gag (p55) et Gag-Pol (p160) polyprot??ines associent ??galement avec la surface interne de la membrane plasmique ainsi que l'ARN g??nomique du VIH comme le virion de formage commence ?? bourgeonner ?? partir de la cellule h??te. Le virion bourgeonn?? est encore immature que le polyprot??ines gag doivent encore ??tre cliv?? dans la matrice r??elle, capside et nucl??ocapside prot??ines. Ce clivage est m??di?? par la protease virale ??galement emball?? et peut ??tre inhib??e par m??dicaments antir??troviraux de la prot??ase classe des inhibiteurs. Les diverses composantes structurelles assemblent ensuite pour produire un virion VIH maturit??. Seuls les virions matures sont alors capables d'infecter une autre cellule.
La variabilit?? g??n??tique
VIH diff??re de nombreux virus en ce qu'il a tr??s ??lev?? variabilit?? g??n??tique. Cette diversit?? est le r??sultat de sa rapide cycle de r??plication , ?? la production d'environ 10 10 virions chaque jour, coupl?? ?? un haut taux de mutation d'environ 3 x 10 -5 par base nucl??otidique par cycle de r??plication et recombinog??niques propri??t??s de la transcriptase inverse.
Ce sc??nario complexe conduit ?? la g??n??ration de nombreuses variantes de VIH chez un patient infect?? unique au cours d'une journ??e. Cette variabilit?? est aggrav?? quand une cellule est infect??e simultan??ment par deux ou plusieurs souches diff??rentes de VIH. Lorsque l'infection simultan??e se produit, le g??nome des virions de la descendance peut ??tre compos??e de brins d'ARN ?? partir de deux souches diff??rentes. Ce virion hybride infecte ensuite une nouvelle cellule o?? il subit la r??plication. Comme cela se produit, la transcriptase inverse, en sautant et-vient entre les deux matrices d'ARN diff??rents, va g??n??rer un r??troviral nouvellement synth??tis?? S??quence d'ADN recombinant qui est un entre les deux g??nomes parentaux. Cette recombinaison est plus ??vident quand il se produit entre des sous-types.
Le ??troitement li??s virus de l'immunod??ficience simienne (SIV) a ??volu?? dans de nombreuses souches, class??s par esp??ces h??tes naturels. Souches du SIV Singe vert africain (SIVagm) et mangabey enfum?? (SIVsmm) sont consid??r??s comme ayant une longue histoire ??volutive avec leurs h??tes. Ces h??tes sont adapt??es ?? la pr??sence du virus, qui est pr??sent ?? des niveaux ??lev??s dans le sang de l'h??te, mais ??voque seulement une r??ponse immunitaire doux, ne provoque pas le d??veloppement de simien SIDA, et ne subit pas la mutation ??tendue et la recombinaison typique du VIH infection chez l'homme.
En revanche, lorsque ces souches infectent les esp??ces qui ne sont pas adapt??s ?? SIV (h??tes "h??t??rologues", tels que les macaques rh??sus ou cynomologus), les animaux d??veloppent le SIDA et le virus engendre la diversit?? g??n??tique similaire ?? ce qui est vu dans l'infection humaine par le VIH. Chimpanz?? SIV (SIVcpz), le plus proche parent g??n??tique du VIH-1, est associ??e ?? une mortalit?? accrue et des sympt??mes similaires au SIDA dans son h??te naturel. VIScpz semble avoir ??t?? transmis relativement r??cente des chimpanz??s et les populations humaines, de sorte que leurs h??tes ne ont pas encore adapt?? au virus. Ce virus a ??galement perdu une fonction de la G??ne Nef qui est pr??sent dans la plupart des SIV; sans cette fonction, d??pl??tion des cellules T est plus probable, conduisant ?? l'immunod??ficience.
Trois groupes de VIH-1 ont ??t?? identifi??s sur la base des diff??rences dans la r??gion de l'enveloppe (env): M, N et O. Le groupe M est le plus r??pandu et est subdivis?? en huit sous-types (ou clades), bas?? sur l'ensemble du g??nome, qui sont g??ographiquement distincts. La plus r??pandue sont les sous-types B (qui se trouve principalement en Am??rique du Nord et en Europe), A et D (qui se trouve principalement en Afrique), et C (trouv??s principalement en Afrique et en Asie); ces sous-types forment des branches dans l'arbre phylog??n??tique repr??sentant la lign??e du groupe M du VIH-1. La co-infection avec sous-types distincts donne lieu ?? des formes recombinantes circulantes (ERC). En 2000, la derni??re ann??e pour laquelle une analyse de la pr??valence globale de sous-type a ??t?? fait, 47,2% des infections dans le monde ??taient du sous-type C, 26,7% ??taient du sous-type A / CRF02_AG, 12,3% ??taient du sous-type B, 5,3% ??taient du sous-type D, 3,2% ??taient des CRF_AE, et 5,3% restants ont ??t?? compos?? d'autres sous-types et les CRF. La plupart du VIH-1 recherche est centr??e sur le sous-type B; peu de laboratoires se concentrent sur les autres sous-types. L'existence d'un quatri??me groupe, "P", a ??t?? ??mise sur la base d'un virus isol?? en 2009. La souche est d??riv??e d'apparemment gorille SIV (SIVgor), d'abord isol?? ?? partir gorilles des plaines occidentales en 2006.
La s??quence g??n??tique du VIH-2 ne est que partiellement homologue de HIV-1 et plus ??troitement ressemble ?? celle de SIVsmm.
Diagnostic
Beaucoup de gens s??ropositifs ne savent pas qu'ils sont infect??s par le virus. Par exemple, en 2001 moins de 1% de la population urbaine sexuellement actifs en Afrique avait ??t?? test??, et cette proportion est encore plus faible dans les populations rurales. En outre, en 2001, seuls 0,5% des femmes enceintes qui fr??quentent les centres de sant?? urbains sont conseill??s, test?? ou de recevoir les r??sultats des tests. Encore une fois, cette proportion est encore plus faible dans les ??tablissements de sant?? en milieu rural. Depuis donateurs peuvent donc ??tre conscientes de leur infection, donneur de sang et produits sanguins utilis??s en m??decine et la recherche m??dicale sont syst??matiquement un d??pistage du VIH.
VIH-1 test est d'abord par un enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) pour d??tecter des anticorps dirig??s contre le VIH-1. Les ??chantillons avec un r??sultat non r??actif de la premi??re ELISA sont consid??r??s comme s??ron??gatifs ?? moins qu'une nouvelle exposition ?? un partenaire infect?? ou partenaire de statut VIH inconnu se est produite. Les ??chantillons avec un r??sultat ELISA r??active sont retest??s en double exemplaire. Si le r??sultat de l'un des essais en double est r??actif, l'??chantillon est signal?? comme r??actif de mani??re r??p??t??e et subit des tests de confirmation avec un test compl??mentaire plus sp??cifique (par exemple, Western blot ou, moins fr??quemment, un immunofluorescence (IFA)). Seuls les sp??cimens qui sont r??activit?? r??p??t??e par ELISA et positive par IFA ou r??active par Western blot sont consid??r??s comme VIH-positif et r??v??latrice d'une infection par le VIH. Les ??chantillons qui sont ?? plusieurs reprises ELISA r??actif de temps en temps fournir un r??sultat Western blot ind??termin??e, qui peut ??tre soit une r??ponse d'anticorps incomplet au VIH chez une personne infect??e ou des r??actions non sp??cifiques ?? une personne non infect??e.
Bien IFA peut ??tre utilis??e pour confirmer l'infection dans ces cas ambigus, ce test ne est pas largement utilis??. En g??n??ral, un deuxi??me ??chantillon devraient ??tre collect??es plus d'un mois plus tard et ?? nouveau test??s pour les personnes ayant une dur??e ind??termin??e r??sultats de Western blot. Bien que beaucoup moins couramment disponibles, tests d'acide nucl??ique (par exemple, l'ARN viral ou proviral m??thode d'amplification de l'ADN) peut ??galement aider au diagnostic dans certaines situations. En outre, quelques ??chantillons test??s pourraient fournir des r??sultats peu concluants en raison d'un ??chantillon de faible quantit??. Dans ces situations, un deuxi??me ??chantillon est pr??lev?? et test?? pour le VIH.
Tests moderne VIH est extr??mement pr??cis. Un test de d??pistage simple est correcte plus de 99% du temps. La chance d'un r??sultat faussement positif dans le protocole de test en deux ??tapes standard est estim?? ?? environ 1 250 000 dans une population ?? faible risque. Test post-exposition est recommand?? au d??but et ?? six semaines, trois mois et six mois.
Recherche
Recherche sur le VIH / sida comprend tous la recherche m??dicale qui tente de pr??venir, traiter ou gu??rir le VIH / SIDA ainsi que la recherche fondamentale sur la nature du VIH comme un agent infectieux et le sida, la maladie caus??e par le VIH.
Actuellement, aucun rem??de pour le VIH / sida existe. La m??thode la plus universellement recommand??e pour le la pr??vention du VIH / SIDA est d'??viter le contact de sang ?? sang entre les gens et pratiquer autrement sexe s??r. La m??thode la plus recommand??e pour le traitement du VIH est pour Personnes s??ropositives re??oivent l'attention d'un m??decin qui coordonnerait le patient de la gestion du VIH / SIDA. Il n'y a pas de rem??de pour le VIH / sida .
De nombreux gouvernements et institutions de recherche participent ?? la recherche VIH / sida. Cette recherche comprend comportementale interventions de sant??, tels que la recherche en l'??ducation sexuelle, et le d??veloppement de m??dicaments, tels que la recherche en microbicides pour les maladies sexuellement transmissibles, Vaccins contre le VIH, et m??dicaments antir??troviraux. D'autres domaines de recherche m??dicale comprennent les sujets de prophylaxie pr??-exposition, prophylaxie post-exposition, et La circoncision et le VIH.
Histoire
D??couverte
SIDA a ??t?? observ?? cliniquement en 1981 aux ??tats-Unis. Les premiers cas ont ??t?? un groupe de consommateurs de drogues injectables et les hommes homosexuels sans cause connue d'alt??ration de l'immunit?? qui a montr?? des sympt??mes de Pneumonie ?? Pneumocystis carinii (PCP), une infection opportuniste rare qui a ??t?? connu pour se produire chez les personnes ayant un syst??me immunitaire tr??s affaibli. Peu de temps apr??s, les hommes gais suppl??mentaires ont d??velopp?? un cancer de la peau rare auparavant appel?? Le sarcome de Kaposi (KS). Beaucoup plus de cas de PCP et KS ont ??merg??, alertant US Centers for Disease Control and Prevention (CDC) et un groupe de travail a ??t?? form?? CDC de surveiller l'??pid??mie.
Au d??but, la CDC ne avait pas un nom officiel de la maladie, se r??f??rant souvent ?? elle par des maladies qui y ??taient associ??es, par exemple, lymphad??nopathie, la maladie apr??s quoi les d??couvreurs du VIH ?? l'origine appel?? le virus. Ils ont ??galement utilis?? le sarcome de Kaposi et des infections opportunistes, le nom par lequel un groupe de travail avait ??t?? mis en place en 1981. Dans la presse g??n??raliste, le GRID terme, qui se ??levait pour immunod??ficience li??e gay, avait ??t?? invent??. La CDC, ?? la recherche d'un nom, et en regardant les communaut??s infect??es invent?? "la maladie 4H??, comme il semble d??signer les Ha??tiens , les homosexuels, les h??mophiles et les utilisateurs d'h??ro??ne. Cependant, apr??s avoir d??termin?? que le sida n'a pas ??t?? isol?? ?? la communaut?? gay, on a r??alis?? que le GRID terme ??tait trompeuse et le sida a ??t?? introduit lors d'une r??union en Juillet 1982. En Septembre 1982, la CDC a commenc?? ?? utiliser le nom sida.
En 1983, deux groupes de recherche distincts dirig??s par Robert Gallo et Luc Montagnier ind??pendamment d??clar?? qu'un nouveau r??trovirus peut avoir ??t?? infecte les malades du SIDA, et publi?? leurs r??sultats dans le m??me num??ro de la revue Science. Gallo a affirm?? que son groupe un virus avait isol?? d'un patient atteint du SIDA ??tait remarquablement similaire dans la forme ?? d'autres virus T-lymphotrope humain (HTLV) son groupe avait ??t?? le premier ?? isoler. Le groupe de Gallo appel?? leur nouvellement isol?? virus HTLV-III. Dans le m??me temps, le groupe de Montagnier isole un virus d'un patient pr??sentant un gonflement de la les ganglions lymphatiques du cou et faiblesse physique, deux sympt??mes classiques du SIDA. Contredisant le rapport du groupe de Gallo, Montagnier et ses coll??gues ont montr?? que les prot??ines de base de ce virus immunologiquement ??taient diff??rents de ceux de HTLV-I. Le groupe de Montagnier appel?? leur virus associ?? ?? la lymphad??nopathie virus isol?? (VBL). Comme ces deux virus se est av??r?? ??tre le m??me, en 1986, LAV et HTLV-III ont ??t?? rebaptis?? VIH.
Origines
Les deux sont soup??onn??s VIH-1 et VIH-2 pour avoir provenu non humain primates en Afrique occidentale et centrale et ont transf??r?? ?? l'homme (un processus connu sous le nom zoonose) au d??but du 20e si??cle. VIH-1 semble avoir son origine dans le sud du Cameroun ?? travers l'??volution de SIV (CPZ), un virus de l'immunod??ficience simienne (SIV) qui infecte sauvages chimpanz??s (VIH-1 descend du SIVcpz end??mique dans la sous-esp??ce de chimpanz??s Pan troglodytes troglodytes). Le parent le plus proche du VIH-2 est SIV (SMM), un virus de la mangabey enfum?? (Cercocebus atys atys), un vieux singe monde vivant dans litoral Afrique de l'Ouest (du sud du S??n??gal ?? l'ouest de la C??te d'Ivoire ). Nouveaux singes du monde comme le hibou singe sont r??sistants ?? l'infection VIH-1, peut-??tre en raison d'un g??nomique la fusion de deux g??nes viraux de r??sistance. VIH-1 est pens?? pour avoir franchi la barri??re des esp??ces ?? au moins trois reprises, donnant lieu ?? trois groupes de virus, M, N et O.
Il existe des preuves que les humains qui participent ?? activit??s de viande de brousse, soit en tant que chasseurs ou comme vendeurs de viande de brousse, commun??ment acqu??rir SIV. Cependant, un virus SIV est faible, et il est g??n??ralement supprim??e par le syst??me immunitaire humain dans les semaines suivant l'infection. On pense que plusieurs transmissions du virus d'un individu ?? en succession rapide sont n??cessaires pour permettre assez de temps pour muter en VIH. En outre, en raison de son taux de transmission de personne ?? personne relativement faible, il ne peut se r??pandre dans la population en pr??sence d'un ou plusieurs canaux de transmission ?? haut risque, qui sont cens??s avoir ??t?? absent en Afrique avant le 20e si??cle .
Canaux de transmission sp??cifiques propos??es ?? haut risque, ce qui permet au virus de se adapter ?? l'homme et se propage dans toute la soci??t??, d??pendent de la date propos??e pour le passage de l'animal ?? l'homme. Les ??tudes g??n??tiques du virus sugg??rent que le plus r??cent anc??tre commun du groupe VIH-1 M remonte ?? vers 1910. Les partisans de cette rencontre le lien de l'??pid??mie de VIH avec l'??mergence de le colonialisme et la croissance des grandes villes africaines coloniales, conduisant ?? des changements sociaux, y compris un degr?? plus ??lev?? de la promiscuit?? sexuelle, la propagation de la prostitution, et la fr??quence ??lev??e concomitante de ulc??rations g??nitales (tels que syphilis) dans les villes coloniales naissantes. Bien que les taux de transmission du VIH lors de rapports vaginaux sont faibles dans des circonstances ordinaires ils sont augment??s de nombreuses fois si l'un des partenaires souffre d'un infection sexuellement transmissible entra??nant des ulc??res g??nitaux. D??but des ann??es 1900 villes coloniales ??taient notables en raison de leur forte pr??valence de la prostitution et des ulc??res g??nitaux dans la mesure o?? ?? partir de 1928 autant que 45% des r??sidents des femmes de l'est de Kinshasa ont ??t?? pens?? pour avoir ??t?? prostitu??es et ?? partir de 1933 environ 15% de tous les r??sidents de la m??me ville ont ??t?? infect??es par l'une des formes de syphilis.
Un autre point de vue que les pratiques m??dicales dangereuses en Afrique au cours des ann??es suivantes la Seconde Guerre mondiale, comme la r??utilisation non st??rile des seringues ?? usage unique lors de la vaccination de masse, des campagnes de traitement antibiotique et anti-paludisme, ??taient le vecteur initial qui a permis au virus de se adapter ?? l'homme et propagation.
Le cas plus t??t bien document?? du VIH chez un humain remonte ?? 1959 ?? Congo . Le virus peut avoir ??t?? pr??sente aux ??tats-Unis d??s 1966.
