Écologie microbienne

L'écologie microbienne aborde la place et le rôle des micro-organismes dans un habitat (environnement, écosystème) ainsi que les interactions des micro-organismes entre eux et avec leur milieu.

L'écologie microbienne consiste à caractériser la biodiversité microbienne d'un écosystème, à caractériser les interactions entre micro-organismes (chaînes trophiques), à identifier le rôle des micro-organismes dans l'écosystème, à étudier les interactions hôtes-microorganismes (symbiose, commensalisme, parasitisme, agent pathogène…).

Les micro-organismes étant très nombreux, ubiquistes (présents partout dans le monde), très diversifiés, très adaptatifs, ont une importance primordiale dans de nombreux domaines. L'écologie microbienne couvre donc des domaines très variés.

• Cycle biogéochimique de la matière : importance de la biodiversité microbienne dans les cycle du carbone, cycle de l'azote, cycle du soufre, cycle du phosphate…
• Dépollution : dépollution naturelle des milieux grâce aux micro-organismes et utilisation des micro-organismes dans le traitement des eaux usées ou des sols pollués.
• Agriculture : interaction des micro-organismes avec les plantes (symbiose ou pathogène).
• Médecine humaine et vétérinaire : importance des parasites, des bactéries et virus pathogènes.
• Agroalimentaire : importance de la biodiversité microbienne dans des processus de transformation ou de fermentation de produits alimentaires (fromage, yaourt, vin, choucroute, saucisson…) ; rôle de certains micro-organismes dans l'altération de produits alimentaires. Maîtrise des contaminations via la maîtrise des flores en place soit une stratégie du type occupation de la place
• Biotechnologie : connaissance de la biodiversité microbienne pour caractériser des nouvelles molécules ayant des propriétés intéressantes pour les milieux pharmaceutiques et/ou industriels.
• Évolution : l'organisme ancestral ayant entraîné l'apparition de la vie était probablement proche des bactéries actuelles.
• Maîtrise des flores pathogènes via un ensemencement contrôlé.

Voir aussi

Articles connexes

• Microbe
• Écologie microbienne du saucisson

Liens externes

• Cours sur l'écologie microbienne des aliments (protection contre les bactéries) poly 19 p. illustrées, prof. Corpet, École nationale vétérinaire de Toulouse 2004.

http://www.presses-univ-pau.fr/cart/Details/101/4/sciences-humaines/ecologie-microbienne.html Traité d'écologie microbienne en français, paru aux presses universitaires de Pau

• Portail de la microbiologie
• Portail de la biologie
• Portail de l’écologie